Membentuk Departemen/Program Studi yang bereputasi internasional dalam pengembangan dan penerapan ilmu pengetahuan, teknologi, dan seni di bidang akuakultur berkelanjutan berdasarkan nilai-nilai Islam pada tahun 2030".
- Menyelenggarakan sistem pendidikan dan pengajaran yang berkualitas untuk menghasilkan sumber daya manusia sarjana yang bereputasi dan berkompeten tinggi dalam hal pengetahuan, keterampilan, dan sikap di bidang budidaya perairan berkelanjutan yang berlandaskan nilai-nilai Islam.
- Menyelenggarakan penelitian dalam rangka mengembangkan ilmu pengetahuan, teknologi, dan seni di bidang budidaya perairan (akuakultur) berkelanjutan yang berlandaskan nilai-nilai Islam.
- Menyelenggarakan kegiatan pengabdian kepada masyarakat untuk menerapkan ilmu pengetahuan, teknologi, dan seni di bidang budidaya perairan berkelanjutan yang berlandaskan nilai-nilai Islam.
- Menjalin dan meningkatkan kerjasama dengan berbagai pihak baik instansi pemerintah, swasta maupun lembaga terkait lainnya, baik di tingkat regional, nasional maupun internasional untuk meningkatkan kompetensi dan reputasi lulusan..
Setiap misi mempunyai tujuan yang menjadi pedoman pelaksanaan visi dan misi, yaitu:
- Menghasilkan sumber daya manusia (sarjana) yang mempunyai reputasi tinggi, kompeten, berakhlak mulia dalam setiap tindakan, serta mempunyai kemandirian dalam menerapkan ilmu pengetahuan, teknologi, dan seni di bidang budidaya perairan berkelanjutan yang berlandaskan nilai-nilai Islam.
- Menghasilkan karya ilmiah yang dimuat pada jurnal bereputasi dalam upaya mengembangkan ilmu pengetahuan, teknologi, dan seni di bidang budidaya perairan berkelanjutan yang berlandaskan nilai-nilai Islam.
- Memproduksi dan mendiseminasikan teknologi terapan di bidang budidaya perairan berkelanjutan yang berlandaskan nilai-nilai Islam kepada masyarakat, institusi pemerintah, dan institusi swasta lainnya..